辽宁省地方税务局为辽宁省人民政府直属机构，正厅级建制。省局机关内设机构共16个：办公室、计划统计处、财务管理处、政策法规处、征收管理处、稽查管理处、流转税管理处、企业所得税管理处、财产与行为税管理处、个人所得税管理处、社会保险费征收管理处、纳税服务处、人事处、教育处、机关党委、监察处。
省局机关下设2个直属局：稽查局、沈阳分局。
省局机关下设4个事业单位及1个群团组织：辽宁省地方税务局税收数据管理中心、发票管理所、机关综合服务中心、培训中心、辽宁省国际税收研究会（群团组织）。
地市局共14个：沈阳市地方税务局、大连市地方税务局、鞍山市地方税务局、抚顺市地方税务局、本溪市地方税务局、丹东市地方税务局、锦州市地方税务局、营口市地方税务局、阜新市地方税务局、辽阳市地方税务局、铁岭市地方税务局、朝阳市地方税务局、盘锦市地方税务局、葫芦岛市地方税务局，其中大连市地方税务局未列入辽宁省地税系统垂直管理体制，由大连市政府直接管理。
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