办公室：
负责局机关日常政务和事务工作；负责有关重要会议的组织，起草审核重要文件，综合税收信息，督办上级机关交办的事项；制定机关内部规章制度；负责文电处理、文书档案、保密、调研、信访和机关财务管理工作。
政策法规处：
负责税收政策的调查研究；组织起草地方税收法规和实施细则；审核各部门、行业法规中有关地方税收的条款，监督检查地方税收法规、规章执行情况；承担税收法规文件汇编、印发工作；办理税务行政诉讼和行政复议。
税收管理一处：
负责营业税、资源税、城市维护建设税等的征收管理工作；处理执行税法和税收政策中的有关事项。
税收管理二处：
负责车船使用税、房产税、城镇土地使用税、土地增值税、印花税、筵席税、因产和增予税的的征收管理工作，并根据国家税收政策，制定本省的实施细则和管理办法；负责办理减免税的有关业务。
税收管理三处：
负责地方企业所得税（包括国有、集体、私营）和个人所得税的征收管理工作；负责集体企业的财务管理工作。
征收管理处：
根据国家税收政策、法令，制定本省综合性的税收征管、票证管理办法和税收法规的执行程序以及具体执行办法，并组织实施；出力执行税收征管法规、条例中的有关事项，强化和完善税收征管手段，监督检查地税系统各部门工作人员执行征管制度的情况。
计划财务处：
管理地税系统的经费、财务、装备和固定资产；监督执行地税系统财务制度；审核编制市（州）地方税务局的财务预算、决算；办理各项经费的核拨；汇总分析全省地方税收会计、统计信息数据；拟定税收计划和会计、统计制度，并监督检查执行情况。
国际税务管理处：
贯彻执行涉外税收法规，组织实施全省涉外税收的征收管理工作；指导全省涉外企业税政业务，负责涉外税收政策的解释、宣传和培训工作；负责涉外企业税收优惠政策的制定和执行以及反避税工作；负责涉外企业税务登记证的换发工作。
人事处：
拟定全省地税系统人事管理制度；管理全省地方税务系统机构设置、人员编制和劳动工资计划；承办省局机关、直属单位处（局）长（主任）、副处（局）长（副主任）及科级干部，各市（州）地方税务局局长、副局长、纪检组长和各县（市、区）地方税务局局长以及上述同等职务人员的考核、任免呈报工作；承办系统内职工的调配、考核、奖惩、晋级、抚恤、考勤、退休、外事等工作；负责统计报表、人事档案管理工作。
宣传教育处：
负责全省地税税法宣传和地税系统职工队伍的思想政治工作及精神文明建设；组织安排地税干部的岗位培训和学历教育。
监察室：
监察室是省监察厅派驻机构，主要职责是依据《中华人民共和国行政监察法》，监督检查税务系统工作人员在遵守执行法律、法规和政府决定、命令中的情况。抓好所属单位的廉政勤政建设和反腐败工作，督促、协调和研究、制订本系统综合治理腐败的有效措施。充分发挥其“监督、教育、保护、惩处”的职能。
机关党委：
负责局机关和直属单位的党群工作。
稽查局：
稽查局具有独立的行政执法主体资格。其主要职责是：依照国家税收法律、法规，监督、检查各地区、地方各企事业单位执行税收政策、法令和征收管理情况；负责全省税务稽查工作的组织、管理、指导和协调以及指导案件的查处工作；受礼查处偷税、漏税、抗税及其他重大税务违纪违法案件；拟定税务稽查各项规章制度，并组织实施，督促检查。
基金征收局
对各项基金进行组织征收和管理，负责编制、下达年度征缴计划，并对各地执行计划情况进行监督和考核；承办专用票证和征管文书的印制和发放；负责会计核算和会计报表的报送工作；负责与社保、财政、银行等部门的协调，即使提供征缴信息资料，衔接和解决征缴中存在的问题；调查研究，为费改税做好前期基础工作。
直属征收管理局：
负责车辆税收的征收管理工作。
发票管理中心：
对全省发票管理进行指导；组织全省性的发票检查工作；查处举报和发现的重大发票违法票据案件；承办设计各行业普通发票的种类和式样；审批各地用票计划并组织印制和发放；制作、发放发票监制章，对发票使用情况进行监督。
干部培训中心：
根据国家税务总局专门业务培训工作有关规定，结合全省地税系统工作实际，研究制定本单位专门业务培训的具体管理办法、实施方案和工作计划，并统一协调、指导、管理本单位专门业务培训工作；组织公务员专门业务培训需求调查，协调业务部门培训需求；组织实施专门业务培训级别考试；计划管理专门业务培训经费等。
计算机信息中心：
建立、开发和维护地税系统计算机征管网络，提供税收信息，指导全省地税系统信息化工程和办公自动化建设；制定全省地税系统信息化建设规划，并组织实施；负责全系统各项计算机管理制度、标准、方案的制定；负责指导全省信息网络建设和系统内软件的开发、推广应用和维护；指导系统内硬件配置；负责系统内计算机专业人员的知识更新的培训。
机关后勤服务中心：
保证机关工作正常运转，对机关运行起保障服务功能。
甘肃省地方税务局所辖十四个市、州地方税务局：兰州市地方税务局、嘉峪关市地方税务局、金昌市地方税务局、白银市地方税务局、天水市地方税务局、酒泉市地方税务局、张掖市地方税务局、武威市地方税务局、定西市地方税务局、陇南市地方税务局、平凉市地方税务局、庆阳市地方税务局、临夏州地方税务局、甘南州地方税务局。
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