深圳市地税局机关设办公室、人事教育处、监察室（与纪检组合署办公）、思想政治工作办公室、政策法规处、征收管理处、计划财务处、流转税管理处、企业所得税管理处、个人所得税管理处、涉外税收管理处、计算机技术管理处；直属事业单位有：数据处理中心、机关服务中心。
深圳市地税局下设征管单位包括：罗湖区、福田区、南山区、蛇口、盐田区、宝安区、龙岗区、保税区地方税务局，稽查局、第一、二、三、四、五稽查局、税源管理局、纳税服务局，在特区外各镇还设立了税务所。
机关处室职能
办公室
【职责】负责局机关政务和信访、文秘、收发、档案的管理，起草和审核有关文件和报告；负责会议组织、保密、办公自动化、税收宣传、政务信息和新闻发布等工作；制定机关内部综合性规章制度。
人事教育处
【职责】按权限或授权负责全市地方税务部门的机构编制、干部考核任免、人事、出国（境）人员政审、离退休人员管理等日常工作；负责本系统人员的岗位培训、业务技能培训、知识更新培训和学历教育的规划、监督、检查和管理，指导开发岗位培训、业务技术能培训和知识更新培训。
监察室（与纪检组合署办公）
【职责】负责对地方税务人员的法制教育、党风党纪政纪和廉政教育；负责下属各单位和税务人员的执法情况的监督、检查；负责查处税务人员行政违法和税务执法违纪案件；负责本级机关并指导下属单位的纪检、监察工作；配合有关部门进行干部在任、离任审计。
思想政治工作办公室
【职责】负责全市地方税务部门的宣传教育、党建、机关党务、基层建设、统战、思想政治工作和精神文明建设，指导共青团、工会、妇联工作。
政策法规处
【职责】负责税政调查研究；组织拟订地方税收业务的规章制度；审核重要的税收规范性文件；监督检查地方税收法规、规章执行情况；承办行政处罚工作；办理税务行政诉讼、行政复议、行政赔偿；指导地方税收法制工作；组织实施和指导税收普法教育；指导税务学术团体的日常工作。
征收管理处
【职责】负责指导、监督、检查和处理全市地方税务系统执行税收征管政策法规规定的有关事项，组织实施征管体制改革，强化和完善征管手段；指导税务登记、申报、属地征收和征管资料的管理以及地方税发票的印制和管理工作；负责注册税务师管理工作，规范税务代理行为；负责纳税人办税业务培训的计划和统筹管理。
计划统计处
【职责】负责贯彻执行全市税收计划、会计、统计制度；分析和预测宏观、区域、行业税收情况；编制全市税收收入长远规划和近期计划；编制、分配和调整年度税收计划以及检查、督促、分析计划的执行情况；监督、检查税收会计、统计制度的执行情况；负责全市地方税收票证的印制、使用和管理。
财务管理处
【职责】负责全系统经费预算编制和部门预算、决算管理；监督、指导全系统财务管理工作；负责系统内部财务审计计划的制定和组织实施。
税政一处
【职责】负责营业税、城市维护建设税、教育费附加等税、费的征收管理业务；对有关法律法规在执行中的政策业务问题进行解释和处理；办理和协调有关税收减免中的具体事项。
税政二处
【职责】负责居民企业所得税、个人所得税税收政策和征收管理工作；负责工会费代征管理工作。
税政三处
【职责】负责契税、土地增值税、房产税、车船税、耕地占用税、印花税、文化事业发展基金等地方税、费的征收管理业务；对有关法律法规在执行中的政策业务问题进行解释和处理；办理和协调有关税收减免中的具体事项。
国际税务管理处
【职责】负责国际税收工作；负责统一管理外籍个人所得税税收政策和征收管理工作。
下属征管单位职能
深圳市罗湖区地方税务局
负责罗湖区辖区范围内地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：罗湖区深南东路1076号
邮编：518003
深圳市福田区地方税务局
负责福田区除福田保税区（东起皇岗口岸，西止新洲河东岸，南沿深圳河北岸，北至福强路）和福田区皇岗路、广深高速公路交国花路往南抵深圳河一线以东，红岭路以西，北环大道、泥岗路以南，深圳河以北区域以外范围内，地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：福田区华富路2039号
邮编：518035
深圳市保税区地方税务局
负责福田保税区（东起皇岗口岸，西止新洲河东岸，南沿深圳河北岸，北至福强路）和福田区皇岗路、广深高速公路交国花路往南抵深圳河一线以东，红岭路以西，北环大道、泥岗路以南，深圳河以北区域范围内，地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作；负责全市范围内的涉外反避税工作。
地址：深圳市八卦二路613栋
邮编：518029
深圳市南山区地方税务局
负责南山区东起滨海大道接桂庙路、西至前海湾一线以北的区域范围内，地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：南山区玉泉路28号(即南山区国税局斜对面、深圳市地方税务局第三稽查局原办公楼)
邮编：518052
深圳市蛇口地方税务局
负责南山区东起滨海大道接桂庙路、西至前海湾一线以南的区域范围内，地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：蛇口工业区七路27号四海大厦
邮编：518067
深圳市盐田区地方税务局
负责盐田区辖区范围内地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：盐田区海山路
邮编：518081
深圳市宝安区地方税务局
负责宝安区辖区范围内地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：宝安区宝城21区前进路82号地税大楼
邮编：518101
深圳市龙岗区地方税务局
负责龙岗区辖区范围内地方税纳税人应纳地方税、费的税务登记、征收管理和税务检查工作。
地址：龙岗区中心城建设路2号地税大楼
联系电话：123662
邮编：518172
稽查局
负责全市地方税务（含内、外）稽查工作，受理举报的涉税案件。负责偷税、抗税、骗税、逃避追缴欠税等税收案件的查处和有关部门批、转的涉税案件的立案、调查和处理。
地址：福田区福田路26号
邮编：518033
第一稽查局
负责罗湖区、盐田区辖区范围内地方税纳税人偷税、逃避追缴欠税、骗税、抗税案件的查处工作。
地址：罗湖区梅园西路804号
邮编：518023
第二稽查局
负责福田区辖区范围内地方税纳税人偷税、逃避追缴欠税、骗税、抗税案件的查处工作。
地址：深圳市红荔西景田南路19号
邮编：518034
第三稽查局
负责南山区辖区范围内地方税纳税人偷税、逃避追缴欠税、骗税、抗税案件的查处工作。
地址：深圳市南山区玉泉路28号地税三检大楼
邮编：518052
第四稽查局
负责宝安区辖区范围内地方税纳税人偷税、逃避追缴欠税、骗税、抗税案件的查处工作。
地址：宝安区宝城23区创业路270号
邮编：518101
税源管理局
负责全市经济税源信息的收集、整理、掌握和控制；负责经济税源变化的动态跟踪分析和经济税源发展趋势分析以及经济税源结构分析、主要行业税源分析等；负责全市地税系统纳税评估制度、办法及纳税评估指标体系的建立和维护并组织实施。
地址：深圳市南山区华侨城光华街16号
邮编：518053
纳税服务局
负责全市地税系统纳税服务工作规划、制度、办法、标准的制定、组织实施和监督考核；负责征收宣传、税企信息交流和纳税辅导工作。
地址：福田区新沙路13号
邮编：518048
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